
Das IMF-Team soll den Kopf des internationalen Drogenschmugglerrings "Die goldene Schlange" ausschalten. Prinz Selimun, ein Unterhändler dieser Organisation, bildet den Ausgangspunkt der Aktion. Agent Barney Collier wird dabei schwer verletzt.
Nach dem Attentat nimmt Prinz Selimun Kontakt mit dem Anführer des Drogenkartells "Die goldene Schlange" auf. Das bringt Jim Phelps und sein Team auf die Fährte eines international angesehenen Geschäftsmannes. Phelps und Nicholas locken diesen in eine Falle.
Das IMF-Team muß Prinzessin Elaine vor einem Mordanschlag beschützen. Ihr Tod soll die Demokratisierung von Valence verhindern. Phelps kann den Anführer der verdächtigen Roten Garde dingfest machen. Doch der echte Attentäter will auf dem Filmfest von Valence zuschlagen.
Im Kreuz des heiligen Bonifatius ist ein Mikrochip versteckt. Der Chip beweist die ungeheuren Verbrechen des baltischen Verteidigungsministers Ivan Savitch. Um das Kreuz zu bekommen, lässt Savitch den Priester Vallis gefangen nehmen und foltern. Das ruft Phelps auf den Plan.
General Xang Kai will die Macht im asiatischen Kangji übernehmen. Gemeinsam mit der Terroristin Su Lin, die einen im Exil lebenden Sektenführer zurückholen möchte, will Xang Kai die Hauptstadt mit einem Atomsprengkörper beschießen. Die Schuld soll den USA zugeschoben werden.
In Sardavia plant General Szabos eine Invasion des Nachbarlandes Bucaraine. Das IMF-Team soll Szabos Hauptquartier infiltrieren. Max und Grant werden beauftragt, Szabos Cruise Missiles zu sabotieren. Ein Krieg muss auf jeden Fall verhindert werden.
Das Raumschiff Roger I soll zum ersten privaten Raumflug starten. Die NASA befürchtet einen Terroranschlag, als der Pilot verschwindet. Das IMF-Team gerät als Wissenschaftler getarnt in die Gewalt von General Robat und Captain Rhine, die die USA erpressen wollen.
Der Anführer einer Neonazi-Organisation plant, ähnliche Gruppen mit einem ausgeklügelten Computersystem zu verbünden, und hat einen „Masterplan“, der ihm den Erfolg garantiert.
Kneipenbesitzer McCarron schürt den Hass zwischen den irischen Protestanten und Katholiken. Er will durch illegale Waffengeschäfte von dem fortdauernden Konflikt profitieren. Das IMF-Team versucht, die verfeindeten Parteien zu einer diplomatischen Lösung zu bewegen.
Der reiche New Yorker Hotelbesitzer Daniel Travers ist ein fanatischer Kunstsammler. Kunstwerke, die er nicht kaufen kann, stiehlt er. Jim Phelps soll ein wertvolles Gemälde ausfindig machen, das die Regierung bei Travers vermutet. Als Lockmittel benutzt er einen Degas.
Terrorist Jouseff K. hat ein Virus entwickelt, das die gesamte Weizenernte eines Landes zerstören kann. Er droht, seine biologische Waffe in einem amerikanischen Weizenanbaugebiet auszusetzen. Das MIF-Team muss schnell handeln, um eine Katastrophe zu verhindern.
Michael Otagi beutet die Eingeborenen des Inselstaates New Belgium aus. Er zwingt sie unter unmenschlichen Bedingungen zum Goldschürfen. Unterstützt wird er dabei von dem Weißen Regehr, den die Eingeborenen für einen Gott halten. Das IMF-Team greift ein.
Dr. Phillip Westerly programmiert seine Patienten mit einer Hypnosetherapie zu Attentätern um. Mehrere Anschläge konnte Westerly auf diese Weise erfolgreich durchführen. Der westafrikanische Präsident Kombutu soll das nächste Opfer sein. Als Täter ist Nicholas vorgesehen.
FBI-Agent Russell ist spurlos verschwunden. Der Fall führt Phelps und sein Team in die Westernstadt Pontiac. Die gehört dem ehemaligen Kongressabgeordneten McClintock. Phelps vermutet, dass McClintock insgeheim mit Terroristen zusammenarbeitet.
Phelps soll den kolumbianischen Drogenboss Magdalena in den USA vor Gericht bringen. Durch einen Unfall verliert Shannon bei der Aktion ihr Gedächtnis und verliebt sich in Magdalenas Neffen Luis. Sogar von Hochzeit ist schon die Rede.
Horus Selim ist Direktor des ägyptischen Museums für Altertümer. Phelps verdächtigt ihn der Morde an mehreren Politikern. Das IMF-Team nutzt Selims Faszination für den Gott Seth aus, um an Informationen zu gelangen. Offenbar will Selim das alte Ägypten wieder aufleben lassen.